Núcleo de Genômica Funcional de Plantas NGFP

Responsável: Prof Marcia Pinheiro Margis

A genômica tem como objetivo entender como os genes e a informação genética estão organizados dentro do genoma e como essa organização determina a sua função. A genômica vegetal se iniciou a partir de estudos com a planta modelo Arabidopsis thaliana. Esse esforço agregou um grande numero de cientistas que buscavam dissecar essa planta usando abordagens genéticas, bioquímicas, fisiológicas e de biologia molecular. Enquanto Arabidopsis foi escolhida como modelo entre as plantas dicotiledôneas, o arroz (Oryza sativa), com seu genoma relativamente pequeno, foi selecionado para ser a planta modelo das monocotiledôneas. A determinação da função de todos os genes presentes no genoma do arroz vai requerer estratégias múltiplas, combinando analises de similaridades de seqüência, estudos de perfis de expressão e a análise de mutantes. A disponibilidade de mutantes afetados em um determinado gene constitui uma ferramenta fundamental para relacionar um gene a sua função, seja através da genética direta (Forward Genetics), seja por meio da genética reversa (Reverse Genetics). Na primeira, parte-se de um mutante para a determinação da base genética da mutação; na segunda, o gene seqüenciado constitui o ponto de partida para a seleção de um mutante e posterior análise funcional. A genômica funcional de plantas modelo tais como A.thaliana e arroz, permitirá o entendimento da biologia básica dos vegetais, assim como a exploração de informações genômicas para o melhoramento de espécies cultivadas.

Objetivos

O nosso grupo desenvolve pesquisa na área de genômica funcional com objetivo de caracterizar genes relacionados com as respostas da planta a estresses ambientais. As estratégias utilizadas consistem na identificação de seqüências gênicas relevantes através de buscas em bancos genômicos e de ESTs, obtenção de mutantes nocautes por inserção de transposon, obtenção de linhagens silenciadas via RNAi, análise do transcriptoma por microarranjos de DNA, análise do padrão de expressão por PCR em tempo real, expressão em sistemas heterólogos, etc.

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