{"id":2093,"date":"2019-09-13T16:18:03","date_gmt":"2019-09-13T19:18:03","guid":{"rendered":"https:\/\/www.ufrgs.br\/ciencia\/?p=2093"},"modified":"2019-09-13T16:27:00","modified_gmt":"2019-09-13T19:27:00","slug":"banco-de-dados-desenvolvido-na-ufrgs-reune-genes-impactados-durante-a-infeccao-por-zika-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.ufrgs.br\/ciencia\/banco-de-dados-desenvolvido-na-ufrgs-reune-genes-impactados-durante-a-infeccao-por-zika-virus\/","title":{"rendered":"Banco de dados desenvolvido na UFRGS re\u00fane genes impactados durante a infec\u00e7\u00e3o por Zika v\u00edrus"},"content":{"rendered":"<p>Pesquisadores da UFRGS criaram um banco de dados p\u00fablico e gratuito que re\u00fane os genes cuja express\u00e3o foi alterada devido \u00e0 infec\u00e7\u00e3o por Zika. Chamado de <a href=\"http:\/\/www.zikavid.org\">Zikavid<\/a>, o site compila dados de todos os trabalhos publicados at\u00e9 o momento que avaliaram a express\u00e3o g\u00eanica ap\u00f3s a infec\u00e7\u00e3o pelo Zika v\u00edrus em modelos animais, celulares e demais amostras biol\u00f3gicas. O desenvolvimento do trabalho que resultou no banco de dados foi descrito em <a href=\"https:\/\/link.springer.com\/article\/10.1007%2Fs13365-019-00799-y\">artigo publicado na revista cient\u00edfica internacional <em>Journal of NeuroVirology<\/em><\/a> na \u00faltima quarta-feira, 11 de setembro.<\/p>\n<p>O banco re\u00fane 7.348 genes identificados com express\u00e3o alterada p\u00f3s-infec\u00e7\u00e3o pelo Zika v\u00edrus e 16.984 medi\u00e7\u00f5es de express\u00e3o g\u00eanica ao n\u00edvel de RNA ou prote\u00edna. As informa\u00e7\u00f5es foram extra\u00eddas de 45 artigos \u2013 rastreados a partir de mais de 5 mil trabalhos sobre o Zika dispon\u00edveis na base de dados Pubmed. Conforme explica o professor da Faculdade de Farm\u00e1cia da UFRGS <a href=\"http:\/\/buscatextual.cnpq.br\/buscatextual\/visualizacv.do?id=K4733538H0\">Walter O. Beys da Silva<\/a>, todo o levantamento foi feito de maneira manual. Os pesquisadores, inicialmente, buscaram artigos relacionados ao v\u00edrus e checaram seus t\u00edtulos e resumos. Ao verificarem que algum continha dados sobre a express\u00e3o g\u00eanica, liam-no por completo e baixavam os dados para, ent\u00e3o, inclu\u00ed-los no sistema. O processo levou cerca de um ano e envolveu, al\u00e9m da Faculdade de Farm\u00e1cia, pesquisadores do Hospital de Cl\u00ednicas de Porto Alegre e do Departamento de Bioqu\u00edmica da UFRGS.<\/p>\n<p>O Zikavid permite identificar e rastrear os modelos experimentais mais utilizados para estudos do impacto molecular da infec\u00e7\u00e3o por Zika, as origens dos v\u00edrus mais estudados (amostras cl\u00ednicas brasileiras, africanas ou asi\u00e1ticas, por exemplo), entre outros fatores. A busca pode ser filtrada pelos nomes de genes ou prote\u00ednas, pela cepa do v\u00edrus e pelo tipo de amostra utilizada na pesquisa, como cultura de c\u00e9lulas, tecidos humanos ou testes com camundongos. A disponibilidade desses dados em um \u00fanico banco deve facilitar e agilizar as pesquisas de grupos brasileiros e internacionais relacionadas \u00e0 patologia, \u00e0 terap\u00eautica e ao diagn\u00f3stico da infec\u00e7\u00e3o por Zika. \u201cPara toda a comunidade cient\u00edfica, esse banco com certeza vai acelerar muito a an\u00e1lise dos impactos da infec\u00e7\u00e3o\u201d, enfatiza Silva.<\/p>\n<p>De modo a manter sua relev\u00e2ncia, o banco de dados contar\u00e1 com atualiza\u00e7\u00f5es peri\u00f3dicas. Conforme novos artigos v\u00e3o sendo publicados, os pesquisadores ir\u00e3o coletar os dados e inclu\u00ed-los no sistema. \u201cSer\u00e1 feito, pelo menos, um rastreio mensal\u201d, comenta o professor. Outra inten\u00e7\u00e3o do grupo \u00e9 criar ferramentas de an\u00e1lise integradas ao banco para que os cientistas que o utilizam n\u00e3o precisem export\u00e1-los para outras plataformas. Tamb\u00e9m est\u00e1 em andamento um estudo acerca do pr\u00f3prio conte\u00fado do banco de dados.<\/p>\n<h5><\/h5>\n<h5>Artigo cient\u00edfico<\/h5>\n<p>ROSA, Rafael L. et al. <a href=\"https:\/\/link.springer.com\/article\/10.1007%2Fs13365-019-00799-y\">ZIKAVID &#8211; Zika virus infection database: a new platform to analyze the molecular impact of Zika virus infection<\/a>. Journal of Neurovirology, 11 set. 2019.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Pesquisadores da UFRGS criaram um banco de dados p\u00fablico e gratuito que re\u00fane os genes cuja express\u00e3o foi alterada devido \u00e0 infec\u00e7\u00e3o por Zika. 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