No eixo 3, as Ciências da Natureza, que incluem as disciplinas de Biologia, Física e Química, têm como desafio abarcar os paradoxos, tramas, enlaces e desenlaces produtores de novas perspectivas para a educação e para a vida.  Nesse sentido, propõem-se os questionamentos a seguir como mobilizadores do debate.

1. Como estruturar um laboratório interdisciplinar na Escola, que contemple um imaginário complexo, em que as Ciências e as Artes se articulem gerando novas perspectivas para a educação e para a vida?
2. Como inscrever dinâmicas inovadoras e reveladoras das imbricações entre as Ciências da Natureza e outras áreas do conhecimento, para a reinvenção do cotidiano da Escola?
3. Como desenvolver estratégias de ensino, sem prescindir da integração de conhecimentos, que acolham as diferenças em sala de aula, promovendo a reinvenção e a desnaturalização do olhar do professor e de seus alunos?
4. Qual a possibilidade de utilização da construção da visualidade, a partir do princípio de inclusão em projetos de trabalho interdisciplinares, evidenciando as especificidades das diversas áreas envolvidas e dos diferentes sujeitos implicados?