Área do conhecimento voltada ao desenvolvimento e aplicação de ferramentas computacionais na análise e interpretação de dados e fenômenos biológicos, esta ciência, jovem em comparação à Biologia Molecular e à Biologia Celular, vem assumindo papel central em um amplo espectro de aplicações, da ciência básica à aplicada. No CBiot, a Bioinformática contribuiu para a elucidação do papel da glicosilação de proteínas no crescimento de raízes, que abrindo a perspectiva de desenvolvimento de novos cultivares de importância econômica com maior capacidade de absorção de água e nutrientes, aspecto chave para o desenvolvimento de plantas capazes de crescer adequadamente em solos mais secos e pobres.
Pesquisadores do CBiot vem assumindo destaque no Brasil tanto no desenvolvimento quanto na aplicação de ferramentas computacionais aplicadas a diversos tipos de análises, como aquelas voltadas dados em larga escala (incluindo interatomas e transcritomas), fenótipos celulares envolvidos em patologias como o câncer e o envelhecimento e na área de Inteligência Artificial, com ênfase na concepção de novos algoritmos de Aprendizado de Máquina, Métodos de Busca Heurística e Processamento Massivamente Paralelo. Na sua atuação junto ao Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia Forense (INCT Forense), desenvolve projetos de predição da aparência humana a partir de vestígios biológicos de interesse forense e na construção de tecnologia para identificação e rastreabilidade de Cannabis em território nacional. Em parceria com o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Biologia do Câncer Infantil e Oncologia Pediátrica - INCT BioOncoPed, atua na busca por novos candidatos a fármacos capazes de contribuir para o tratamento de diversos tipos de cânceres pediátricos. Por fim, de forma a estas pesquisas e potencializar novos avanços no futuro, o CBiot vem construindo infraestrutura computacional multiusuário necessária a estudos e desenvolvimentos de tecnologia no âmbito da bioinformática, servindo ainda de suporte para as empresas incubadas na IECBiot.