O Instituto de Matemática e Estatística é integrado pelas seguintes comissões:
Comissão de Graduação de Matemática (COMGRAD/MAT),
Comissão de Graduação em Estatística (COMGRAD/EST),
Comissão de Pesquisa (COMPESQ),
Comissão de Pós-Graduação de Matemática (PPGMAT),
Comissão de Pós-Graduação em Matemática Aplicada (PPGMAp)
Comissão de Pós-Graduação em Ensino em Matemática (PPGEMAT).