O Instituto de Matemática e Estatística é integrado pelas seguintes comissões:
Comissão de Graduação de Matemática (COMGRAD/MAT),
Comissão de Graduação em Estatística (COMGRAD/EST),
Comissão de Pesquisa (COMPESQ),
Comissões de Pós-Graduação de Matemática (PPGMat), de Matemática Aplicada (PPGMAp) e de Ensino em Matemática (PPGENSIMAT).