Considerando a sua missão, a SEAD organizou-se em setores e serviços para atender a seus objetivos.

Assim, a Coordenação Acadêmica é responsável pelo suporte às plataformas institucionais; trabalha de forma integrada à Pró-Reitoria de Graduação no Programa de Monitoria, por meio do oferecimento de bolsas de monitoria para apoio às ações a distância; oferece capacitações para a comunidade acadêmica; promove anualmente editais de fomento às ações vinculadas à educação a distância na Universidade; realiza eventos  para apoiar a discussão e atualização sobre os temas da área.

Para a produção de recursos educacionais voltados ao apoio das ações de educação a distância, a SEAD disponibiliza um setor específico. É o Núcleo de Produção Multimídia para a Educação (NAPEAD).

A Gerência Administrativa é responsável pelo planejamento e gestão orçamentária da SEAD, captação de recursos, compras e contratação de serviços, gestão patrimonial, gestão de bolsas, convênios e protocolos, controle contábil,  assessoria financeira, gestão de pessoal e almoxarifado, entre outras atividades.