Infecções por SARS-CoV-2 em jardins de infância e famílias associadas no início da segunda onda em Berlim, Alemanha.

Doze jardins de infância de Berlim foram visitados entre 28 de setembro e 2 de outubro de 2020. Naquela semana, 1.561 infecções por SARS-CoV-2 confirmadas por PCR foram registradas em Berlim (29 e 43 casos em crianças de 0 a 4 anos e 5 a 9 anos, respectivamente). A incidência de 7 dias foi de 38 casos / 100.000 habitantes e os números começaram a crescer exponencialmente.

Em cada creche, foram recrutadas 20 crianças e 5 funcionários, sempre que possível. Membros da família de crianças e funcionários também foram convidados a participar da pesquisa. Dois terços das instituições avaliadas tinham uma regra de distância física entre a equipe e 91,7% entre a equipe e os pais. O uso obrigatório de máscara facial pelos funcionários foi declarado em 41,7% para contatos parentais e em 8,3% para contatos entre colegas.

No total, 720 indivíduos participaram do estudo (155 crianças em idade pré-escolar, 78 funcionários, 487 membros da família). A idade média das crianças do jardim de infância era 4,4 anos; 40% eram meninas. Os educadores eram predominantemente mulheres de meia-idade. Sinais e sintomas estavam presentes em uma em cada quatro crianças do jardim de infância, incluindo coriza (17,0%), tosse (11,1%) e dor de garganta (2,0%). As queixas principais entre os educadores sintomáticos (28,9%) foram cefaleia (14,7%), coriza (13,5%) e tosse (11,8%). A maioria das crianças do jardim de infância nunca usou uma máscara facial, com taxas de uso substancialmente mais altas entre educadores e membros da família.

Os suabes puderam ser coletados para 98,1% das crianças, todos os educadores e 96,7% dos membros da família. Em nenhuma dessas 701 amostras, o SARS-CoV-2 foi detectado. Apenas um trabalhador da puericultura mostrou sororreatividade para IgG.

Em comparação com os adultos, as crianças com <10 anos de idade parecem ser menos frequentemente infectadas com SARS-CoV-2, apresentam doença bastante leve ou infecção assintomática e podem ser menos infecciosas. Embora a pesquisa tenha ocorrido durante o aumento da atividade pandêmica em Berlim, foi observada ausência de infecção por SARS-CoV-2 entre as crianças dos jardins de infância, funcionários e membros da família.

TRANQUILIZADOR, NÃO É?

Fonte: SARS-CoV-2 infections in kindergartens and associated households at the start of the second wave in Berlin, Germany – a cross sectional study. Thielecke, M., Theuring, S., van Loon, W., Hommes, F., Mall, M. A., Rosen, A., Boehringer, F., von Kalle, C., Kirchberger, V., Kurth, T., Seybold, J., Mockenhaupt, F. P., BECOSS Study Group. medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.08.20245910.

ALERTA DA ANVISA: Identificação de possível caso de Candida auris no Brasil.

O fungo foi identificado em amostra de ponta de cateter de paciente internado por complicações da COVID-19, em UTI geral de um hospital do estado da Bahia.

Candida auris é um fungo emergente que representa uma séria ameaça à saúde pública considerando que apresenta resistência a vários medicamentos antifúngicos comumente utilizados para tratar infecções por Candida. Algumas cepas de C. auris são resistentes a todas as três principais classes de fármacos antifúngicos (polienos, azóis e equinocandinas).

C. auris pode causar infecção em corrente sanguínea e outras infecções invasivas, podendo ser fatal, principalmente em pacientes com comorbidades. Além disso, pode permanecer viável por longos períodos no ambiente (semanas ou meses) e apresenta resistência a diversos desinfetantes.

NÃO É SÓ A COVID-19 QUE É UM RISCO PARA A SAÚDE PÚBLICA.

Fonte: Alerta de Risco GVIMS/GGTES/Anvisa no 01/2020.

Disfunção olfativa e gustativa entre profissionais de saúde positivos para COVID-19.

Os profissionais de saúde foram identificados como um grupo de alto risco para adquirir COVID-19. A Organização Mundial da Saúde incluiu “perda do olfato” e “paladar” entre os sintomas da infecção por COVID-19. A prevalência estimada de disfunção olfativa (DO) e gustativa (DG) entre indivíduos COVID‐19 na população em geral é de 38,5% e 30,4%, respectivamente.

Entre 26 de maio e 10 de junho de 2020, foi realizada uma pesquisa multicêntrica internacional sobre essas duas disfunções em profissionais de saúde positivos para COVID‐19 sintomáticos leves a moderados. A prevalência de alterações olfativas e gustativas relatadas foi de 73,1% e 69,2%, respectivamente, em profissionais de saúde de Londres. Na população total do estudo, entre os 93 profissionais de saúde que tiveram DO, este foi o primeiro sintoma. Da mesma forma, entre os 94 profissionais de saúde que tiveram DG durante a doença, este foi o primeiro sintoma em 14 deles (16,1%) e foi o único sentido em 1 participante (1,1%).

No seguimento de 52 dias, 28 profissionais de saúde (31,8%) relataram que a DO havia se recuperado completamente, enquanto a maioria deles (55,7%) relatou que o olfato havia melhorado, mas ainda estava mais baixo do que antes (hiposmia). Ainda estava ausente (anosmia) em 11 participantes (12,5%).

Em relação ao paladar, 41 profissionais de saúde (47,1%) relataram que a DG estava completamente recuperada no momento da pesquisa. Trinta e oito participantes (43,7%) ainda relataram menor paladar (hipogeusia), enquanto ainda estava ausente (ageusia) em 8 participantes (9,2%).

Este estudo é o primeiro a demonstrar a alta prevalência de DO e DG entre os profissionais de saúde COVID‐19 positivos. É importante ressaltar que até 68% dos profissionais de saúde pesquisados ​​continuaram a ter DO ou DG após 52 dias.

Fonte: Olfactory and taste dysfunction among mild-to-moderate symptomatic COVID-19 positive health care workers: An international survey. Andrews, Peter J.; Pendolino, Alfonso Luca, Ottaviano, Giancarlo, Scarpa, Bruno, Grant, Joseph, Gaudioso, Piergiorgio, Bordin, Anna, Marchese-Ragona, Rosario, Leoni, Davide, Cattelan, Annamaria, Kaura, Anika, Gane, Simon, Hamilton, Nick J.; Choi, David, Andrews, Julie A.. Laryngoscope Investigative Otolaryngology ; n/a(n/a), 2020. https://doi.org/10.1002/lio2.507

CovidRisk: um app que calcula o risco de COVID-19.

Estamos acostumados a usar app para tudo na nossa vida. E se tivéssemos um app para calcular o risco de pegarmos COVID-19? Foi publicado um preprint (artigo ainda não avaliado para publicação em uma revista científica) propondo um app para essa finalidade.

“CovidRisk” é um aplicativo online simples no qual você insere o tamanho do grupo, o número de contatos que terá dentro do grupo, a duração de cada contato e o nível de precauções (níveis baixo, médio ou alto de máscara, distanciamento social, etc.). A ferramenta calcula:

1. Sua chance individual de ser infectado (probabilidade de transmissão) durante um contato com uma pessoa infectada no grupo.

2. Sua chance geral de infecção durante o evento.

3. O número esperado de novas infecções se todos os membros do grupo se misturarem da mesma maneira que você.

Os autores ilustram o cálculo com o evento de super-disseminação do vírus que ocorreu na Casa Branca durante uma recepção em 26 de setembro de 2020 para anunciar a nomeação da juíza Amy Coney Barrett para a Suprema Corte. Aproximadamente 150 convidados compareceram, com muitos abraços e apertos de mão, mas poucas máscaras. Presumiu-se que cada convidado gastou 120 minutos misturando-se com os demais, 12 minutos com cada um dos 10 participantes escolhidos aleatoriamente. Um cenário de prevalência de infectados de 3% (ou seja, 4 ou 5 infectados entre os 150 convidados) e poucas precauções produz uma probabilidade geral de infecção próxima a 5%. O número médio previsto de novas infecções é de 7,12, em linha com as sete infecções suspeitas notificadas após o evento.

Como outro exemplo, foi avaliado o risco de se infectar em um supermercado no estado americano com a maior incidência de Covid-19 em 12 de novembro de 2020. Foi utilizada uma prevalência de infectados de cerca de 1,75%. Foi presumido que havia 50 pessoas na loja e que alguém passou um minuto interagindo com cada um dos dez trabalhadores / clientes observando um nível médio de precauções. O aplicativo calcula que a chance de ser infectado, se a pessoa tiver o azar de entrar em contato com uma pessoa infectada, é de 0,77%, com um risco geral de infecção de 0,54%. Espera-se que uma média de apenas 0,24 pessoas sejam infectadas na loja. Embora possa parecer baixo, significa que o mesmo evento ocorrendo em 100 lojas diferentes resultaria em uma média de 24 infecções.

Os exemplos numéricos fornecidos acima sugerem que reuniões onde as pessoas se misturam por longos períodos com poucas ou nenhuma precaução acarretam altos riscos de transmissão, ao contrário de viagens rápidas a uma loja, mesmo em um local com um alto nível de prevalência da doença. Ao dirigir para um evento social, uma loja ou um estádio durante a pandemia COVID-19, você pode ter uma ideia do risco de infecção e do número aproximado de novos casos durante o evento.

TOMARA QUE ESSE APP SE TORNE UMA REALIDADE. VAI NOS AJUDAR A TOMAR DECISÕES IMPORTANTES NO NOSSO DIA A DIA.

Fonte: CovidRisk: An evidence-based online COVID-19 risk calculator. Marc Artzrouni. medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.01.20241646

Variantes de SARS-CoV-2 associadas a quadros leves ou graves.

Usando dados publicamente disponíveis da GISAID (Global Initiative on Avian Influenza Data), os pesquisadores avaliaram a relação entre as variantes do SARS-CoV-2 e os resultados dos pacientes associados, objetivando entender como as variantes genômicas virais do SARS-CoV-2 estão ligadas ao resultado do paciente com COVID-19.

Foram coletados 155.958 genomas virais juntamente com metadados clínicos. A modelagem sugeriu que o isolamento parcial de casos sintomáticos pode reduzir substancialmente as mortes com menos transmissão em curto prazo. É importante ressaltar que esse isolamento também pode alterar potencialmente o caminho evolutivo do vírus, favorecendo cepas menos virulentas.

Ao priorizar casos e contatos com sintomas (em comparação com casos assintomáticos e seus contatos assintomáticos), além dos esforços de mitigação globais recomendados, pode haver uma pressão seletiva relativa contra cepas que são mais prováveis ​​de causar sintomas. Isso pode favorecer o surgimento de cepas atenuadas a longo prazo.

A existência de uma ferramenta rápida e precisa que pode ajudar a identificar pacientes de COVID-19 que são mais propensos a experimentar sintomas graves ou requerem recursos médicos intensivos (por exemplo, hospitalização e ventilação) pode ajudar os sistemas de saúde a alocar recursos para as regiões com as necessidades mais críticas.

Os pesquisadores demonstraram que algumas variantes genômicas do SARS-CoV-2 são fortes preditores da gravidade da doença COVID-19, e essas variantes parecem estar comumente circulando. Fonte: Variants in SARS-CoV-2 Associated with Mild or Severe Outcome. Jameson D. Voss, Martin Skarzynski, Erin M McAuley, Ezekiel J. Maier, Thomas F. Gibbons, Anthony C. Fries,  Richard R Chapleau. medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.01.20242149

SARS-CoV-2 no Brasil: análise de variância molecular e diversidade genética.

Atenção: este post é sobre um preprint, isto é, artigo ainda não foi avaliado para publicação em uma revista científica.

COVID-19 teve seu primeiro caso registrado no Brasil em fevereiro de 2020 e, desde então, o vírus se expandiu exponencialmente por todo o Brasil. Fatores diversos, como não obediência ao uso de máscaras, lavagem das mãos, uso de álcool a 70%, uma intensa discordância entre membros do governo sobre a prática do isolamento social, uma baixa adesão da população à quarentena, a superstição sobre o vírus infectar apenas pessoas com mais de 60 anos, a falta de compreensão da população sobre a doença ou a negação total de sua existência, o desmantelamento inicial dos poucos hospitais de campo existentes, entre outros, só aumentam as taxas de transmissão, o número de pacientes e, infelizmente, o número de mortes.

Com o uso de metodologias de análise filogenética e estrutura populacional, foi possível detectar a existência de um pequeno grau de semelhança entre os haplótipos do SARS-CoV-2 no Brasil. Todas as análises suportaram que os dados são uma confirmação que não há consenso na conservação do genoma SARS-CoV-2 no Brasil e, portanto, é seguro afirmar que a variabilidade genética do vírus é diferente em diferentes subconjuntos de regiões brasileiras.

Há necessidade urgente de aumento das ações de saúde pública, das estratégias de conscientização, de práticas de higiene e distanciamento social.

Fonte: SARS-CoV-2 in Brazil: analysis of molecular variance and genetic diversity in viral haplotypes found in the states of Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná and Tocantins. Rosane Maria de Albuquerque; Eduarda Doralice Alves Braz Da Silva; Dallynne Bárbara Ramos Venâncio; Robson da Silva Ramos; Pierre Teodósio Felix. bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.02.409037.

Nem todos os vírus da natureza são inimigos humanos.

Até o final da década de 1980, pensava-se que os vírus ocorriam em baixas densidades nos ecossistemas e que seu papel ecológico era insignificante. No início dos anos 1990, esse paradigma foi alterado com o desenvolvimento de novas metodologias para contagem de partículas virais. Atualmente, sabe-se que a densidade de vírus em lagos pode ser da ordem de 10 bilhões de partículas virais para cada litro de água.

Os vírus são importantes no controle de populações em ecossistemas aquáticos. Da mesma forma que vírus como o SARS-CoV-2 afetam drasticamente a dinâmica da população humana, eles também podem controlar o crescimento das populações que habitam os ecossistemas aquáticos. Por exemplo, em média 10% da mortalidade de algas e 40% da mortalidade bacteriana são causadas por infecção viral⁠. Além disso, a infecção viral potencialmente promove a alternância entre as espécies dominantes dentro de uma comunidade bacteriana⁠. Quando uma espécie dominante é atacada por um vírus, sua densidade diminui, permitindo que outras espécies prosperem.

Os vírus são importantes condutores da evolução microbiana, pois são capazes de transferir material genético entre seus hospedeiros por meio de transdução – processo no qual um vírus injeta parte do material genético de um hospedeiro (doador) em um segundo hospedeiro (receptor), que incorpora esses genes em seu próprio material genético e, quando multiplicado, gera uma linhagem com novas características genéticas. Foi demonstrado que esse tipo de transferência lateral de genes ocorre em ecossistemas aquáticos em taxas muito altas.

Os vírus podem prevenir a proliferação de algas prejudiciais ao limitar a sua densidade populacional. O florescimento de algas ocorre quando elas encontram condições ideais de crescimento com altas concentrações de nutrientes originados de fontes naturais ou antropogênicas, como esgoto e atividade agrícola. A eutrofização intensificou o florescimento de algas em todo o mundo, representando um risco para a biota aquática e até mesmo para a saúde humana, uma vez que algumas cianobactérias podem produzir toxinas. Este controle viral sobre as espécies dominantes de bactérias e algas representa uma função ecológica importante desempenhada por vírus em ecossistemas.

O fato de que os vírus infectam e promovem doenças devastadoras em espécies com populações abundantes pode ser problemático, especialmente do ponto de vista da saúde humana. Mas os vírus também desempenham funções ecológicas essenciais para a manutenção da biodiversidade e o ciclo de elementos fundamentais na biosfera.

Fonte: Not all viruses in nature are human enemies: a perspective on aquatic virus ecology in Brazil. Junger, Pedro Ciarlini, Almeida, Rafael Marques, Mendonça, Raquel, Farjalla, Vinicius Fortes, de Melo, Rossana Correa Netto, Roland, Fábio, Barros, Nathan. Acta Limnologica Brasiliensia ; 32:1-9, 2020.

Foco no receptor do SARS-CoV-2

Ainda na linha das inovações associadas à COVID-19, preparamos um extrato de uma notícia divulgada no site da BioManguinhos FIOCRUZ. Leia a notícia original aqui.

O Dr. Jose Procópio Moreno Senna, do Laboratório de Tecnologia Recombinante (Later) submeteu o projeto “Seleção de aptâmeros que se ligam ao receptor ACE-2 (angiotensin converting enzyme) para o bloqueio com a RDB (receptor blinding-domain) da proteína S de SARS-CoV-2” ao Edital Ideias e Produtos Inovadores – COVID-19 – Encomendas Estratégicas do Programa Inova Fiocruz.

O projeto, um dos únicos voltado ao desenvolvimento de uma nova estratégia de tratamento, foi selecionado e traz o aspecto inovador de buscar uma opção terapêutica através da pesquisa não apenas do vírus, mas principalmente de seu receptor no organismo humano.

As pesquisas em andamento focam majoritariamente no vírus, mas pouco em seu receptor. Todo vírus se liga a um determinado receptor, esta é a chave da infecção viral – a ligação da partícula viral com o receptor da célula do hospedeiro. Portanto, impedir esta ligação pode ser uma forma de evitar a infecção pelo SARS-CoV-2. Existem aminoácidos essenciais no receptor para que a interação ocorra. Se você bloquear estes aminoácidos, a ligação é bloqueada.

Existem duas ferramentas disponíveis para ligação a alvos moleculares: os anticorpos monoclonais ou os aptâmeros. Ocorre que os anticorpos monoclonais poderiam causar mais danos que benefícios ao hospedeiro (o ser humano infectado) pois agiriam sobre células em diversas partes do organismo. A opção, então, foi pela busca de um aptâmero. Aptâmeros são oligonucleotídeos (DNA) pequenos e altamente estáveis, não imunogênicos e podem ser produzidos por síntese química em larga escala.

O grupo  pretende desenhar um peptídeo sintético, que seja estável e o mais próximo possível da proteína nativa. As etapas futuras serão a caracterização (aproximadamente 10 aptâmeros que se ligam melhor ao peptídeo sintético), seguidos da avaliação da ligação com a proteína recombinante purificada (ACE-2) e por fim a ligação com o receptor em cultivo de células. O objetivo final é chegar aos aptâmeros que se ligam ao receptor ACE-2. 

É BOM SABER QUE PESQUISADORES BRASILEIROS ESTÃO TRABALHANDO NA VANGUARDA CIENTÍFICA.

Fonte: Foco no receptor do SARS-CoV-2. BIODIGITAL | Edição nº 339 | 10/06/2020

Ferramentas de diagnóstico emergentes para detecção de COVID-19 – parte 4.

Quarta e última parte da série de posts sobre metodologias de diagnóstico inovadoras que estão sendo desenvolvidas para a COVID-19. O artigo original foi publicado na revista Biomedical Microdevices em 24 de novembro de 2020.

Nanotecnologia

Poucos avanços já foram feitos no campo de diagnóstico para COVID-19 usando nanotecnologia. Recentemente, o dispositivo de biossensor baseado em transistor de efeito de campo (FET) para detecção de SARS-CoV-2 foi desenvolvido. A plataforma de biossensor desenvolvida fez uso de FET revestido de grafeno contra proteína spike específica do vírus.

Ultimamente, a eletrônica inteligente surgiu como um campo potencial no desenvolvimento de métodos de detecção de infecções patogênicas. Doenças como câncer, H1N1, HIV e muitas outras foram detectadas com o uso de biossensores. Todos os tipos de biomoléculas, como aptâmeros, ácido nucleico, anticorpos e lipídios, são relatados como sendo detectados por meio de biossensores.

O desenvolvimento do analisador de respiração exalada com base em matriz híbrida de nanomaterial se mostrou preciso na diferenciação de pacientes COVID-19 ou outra infecção pulmonar relacionada. A integração de biossensores em uma tecnologia móvel pode ser o futuro do gerenciamento e detecção de doenças.

Outra aplicação da nanotecnologia na detecção de COVID-19 é o uso de nanopartículas magnéticas revestidas com grupos carboxila, que auxiliam na extração de RNA viral.

Os autores concluem que a necessidade do momento nesta pandemia é o desenvolvimento e o estabelecimento de uma ferramenta diagnóstica inovadora que seja fácil de usar, precisa, sensível e imediata.

FONTE: Emerging diagnostic tools for detection of COVID-19 and perspective. Verma, N.; Patel, D.; Pandya, A.. Biomed Microdevices ; 22(4):83, 2020.

Ferramentas de diagnóstico emergentes para detecção de COVID-19 – parte 3.

Terceira parte da série de posts sobre metodologias de diagnóstico inovadoras que estão sendo desenvolvidas para a COVID-19. O artigo original foi publicado na revista Biomedical Microdevices em 24 de novembro de 2020.

Junto com os testes baseados em ácido nucléico em andamento para detecção de COVID-19, a detecção baseada em proteína também pode atuar como um excelente complemento para uma melhor triagem em massa visando possibilitar medidas precoces em um local de atendimento.

Teste baseado em antígeno

Um teste de antígeno tem a capacidade de revelar se uma pessoa está atualmente infectada com um patógeno como o vírus SARS-CoV-2. Os testes de antígeno detectam principalmente proteínas ou glicanos, como as proteínas Spike encontradas na superfície do vírus SARS-CoV-2. Existem vários kits sendo desenvolvidos.

Ultimamente, uma consideração especial está sendo dada ao teste de antígeno de ponto de atendimento (realizado no local de atendimento do paciente) para detectar a pessoa infectada o mais cedo possível e diminuir as chances de transferência em massa do vírus. No entanto, foi relatado que a detecção baseada em antígeno por si só pode não ser eficaz na detecção de SARS-CoV-2.

Detecção baseada em anticorpos

As imunoglobinas incluem IgG, IgM, IgA, IgE e IgD e podem contribuir na detecção de doenças. O uso de proteínas para detecção é conhecido e adotado ao longo de décadas, mas recentemente o uso de anticorpos neutralizantes foi adotado para lutar contra o novo coronavírus. O anticorpo neutralizante tem como alvo a proteína spike do vírus. Considerando o fato de que os anticorpos neutralizantes têm grande potencial para combater as doenças, seu uso no diagnóstico de doenças pode ser um futuro próximo.

Com base neste conceito, vários testes foram desenvolvidos recentemente. Entre eles, houve o desenvolvimento de um imunoensaio de fluxo lateral de ponto de atendimento, rápido e simples, que pode detectar imunoglobulina M (IgM) e anticorpos IgG contra o vírus SARS-CoV -2 simultaneamente no sangue humano dentro de 15 min, tendo uma sensibilidade geral de teste de 88,66% e especificidade de 90,63%. Este ensaio combinado IgM-IgG resultaria em melhor utilidade e sensibilidade, ao contrário do teste de IgM ou IgG único.

Detecção de COVID-19 baseada em quimioluminescência

O imunoensaio com base quimioluminescente é uma modificação eficaz para superar as desvantagens do imunoensaio tradicional. Um imunoensaio quimioluminescente baseado em peptídeos para detectar IgG e IgM foi proposto para COVID-19. Ao combinar com a detecção de RT-PCR, este ensaio pode ajudar a aumentar a precisão do diagnóstico da infecção por SARS-CoV-2.

O domínio de ligação ao receptor altamente purificado (RBD) da proteína spike do SARS-CoV-2 foi usado para fazer um conjunto de kits de luminescência química para detectar a presença de IgA, IgM e IgG específicos para RBD. Os kits mostraram sensibilidades diagnósticas de 98,6%, 96,8% e 96,8% e especificidades de 98,1%, 92,3% e 99,8%, respectivamente.

QUANTA INOVAÇÃO! MAS NÃO PERCAM A CONTINUAÇÃO AMANHÃ.

FONTE: Emerging diagnostic tools for detection of COVID-19 and perspective. Verma, N.; Patel, D.; Pandya, A.. Biomed Microdevices ; 22(4):83, 2020.